بر این اساس، مسائل، درخواستها و اعتراضات صرفا علمی، آموزشی و پژوهشی اعضای هیاتهای علمی و اساتید و دانشجویان دانشگاههای زیر نظر وزارتخانه های علوم و بهداشت و دانشگاه آزاد اسلامی پس از این در هر یک از این مجموعهها، در هیاتی که متشکل از وزرای علوم و بهداشت یا رییس دانشگاه آزاد، معاون حقوقی وزرای علوم و بهداشت یا رییس دانشگاه آزاد، معاون تخصصی ذیربط وزرای علوم و بهداشت یا رییس دانشگاه آزاد، سه نفر از اعضای هیات علمی به انتخاب وزرای علوم و بهداشت یا رییس دانشگاه آزاد، ۲ نفر از اعضای شورایعالی انقلاب فرهنگی به انتخاب اعضای این شورا و دبیر شورایعالی انقلاب فرهنگی است، مورد رسیدگی قرار خواهد گرفت.
این هیاتها همچنین در مسائل صرفا علمی، آموزشی و پژوهشی مربوط به خانواده دانشگاهی، بر عملکرد دانشگاههای زیر نظر خود نیز نظارت خواهند کرد.